V listopadu 2003 odsouhlasila Poslanecká sněmovna
České republiky návrh praporu a brzy po té udělil předseda sněmovny
Miletínu právo k jeho užívání. Veřejnosti byl představen při
slavnostním posvěcení při pouťové mši v miletínském kostele
Zvěstování Panny Marie 25. dubna 2004.
Prapor vychází ze stejné symboliky, jako znak.
Jeho základem je červený svatojiřský kříž v bílém poli, který je
doplněn ve vlající části barvami Valdštejnů - tím je
respektováno umístění valdštejnského štítu na městském znaku. Krátce
po svém vysvěcení se tak mohl stát součástí vlajkoslávy v den vstupu
do Evropské unie.